在开题报告查重过程中，处理参考文献是非常重要的一环。首先，要确保参考文献的引用格式符合要求，包括文献格式、标点符号等。其次，可以通过修改引用方式，如改变引用顺序或添加引用内容，来增加查重的差异性。另外，可以适当增加自己的观点或总结，减少直接引用的内容，以降低重复率。同时，还可以通过修改文献的语言表达方式，使用同义词替换或改变句式结构，使文献更具原创性。

另外，对于一些常见的引用内容，可以尝试进行删减或修改，以减少与他人的雷同度。还可以通过增加自身研究成果或实验数据，来增加开题报告的独特性。此外，可以尝试引用一些较新的文献或权威性的资料，以提高文献的质量和独特性。总之，在处理参考文献时，需要注意保持文献的完整性和准确性的前提下，尽量增加原创性和独特性，从而提高开题报告的质量和通过查重的几率。